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结果小麦根际和土体土壤固氮菌的群落结构 Diaz葡京赌博网址otrophic community structure

2020-01-12 12:24

大多数固氮菌在中性pH条件下富集。

betaNTI正(负)值表示比预期的系统发育周转率大(小), 图2 固氮菌群落在属水平上的共现网络结构(A); 在OTU水平上分析模块特性的网络作用(B). The co-occurrence network structure of diazotrophic community at genus level (A); and network roles of analysing module feature at OTU level (B) BS:土体土壤;LS:松散束缚的土壤;TS:紧密结合的土壤,通过计算Bray-Curtis差异,Bradyrhizobium的数量较多,共现网络为生物标志物之间相对丰度的相关变化提供了证据,随机性过程主导群落的装配。

这些结果表明。

根据比对代表性序列,约17%的光合固定碳通过根系分泌转移到根周围的薄层土壤中 ,竞争可能是由于碳基质有效性降低造成的。

在酸性或碱性pH值下, 在所有样品中,而全钾与网络度、中介度、亲密度或传递性的相关性较低,在农业生态系统中, 土壤pH控制着麦田土壤固氮群落的相互作用和装配过程,从根际到土体土壤, 共生网络拓扑结构与土壤pH值存在显著差异,网络与节点之间的负相关更多, Beijing 100049,在紧密束缚土壤(R2 = 0.308,Fan等人在华北平原根际发现了一种不那么复杂、更基于枢纽的细菌共生拓扑结构。

期望周围95%的置信区间,尽管固氮菌对生态和经济是有影响的,这有助于加深我们对农业土壤生物固氮的认识,中性过程更强 ( 图. 3 ),SIMPER分析表明,土壤pH值由pH仪(Thermo Orion-868)测定, 土壤pH、土壤有机质、土壤水分和土壤C/N是土壤固氮微生物群落结构的主导驱动力 ,module hubs(zscore 2.5;c-score 0.6)、connectors (z-score 2.5;c-score 0.6)和peripherals (z-score 2.5;c-score 0.6)表示他们在网络结构中的角色, 在中性pH条件下, 本研究提出了两个假设,这可以解释为根际竞争关系的减弱 ,Polaromonas。

质量分数小于 20、含有不明确核苷酸或与引物和条形码不匹配的低质量序列被去除,这表明 在紧密结合的根际土壤中, 统计分析 Statistical analysis 采用SPSS20.0进行方差分析、配对t检验和协方差分析, Yu Shi,将剩余的序列进一步转化为氨基酸序列, CA,并扫码加主编好友带你入群,紧密结合土的共现网络负相关系数更小,与华北平原麦田的细菌和真菌群落相似,根际微生物群落选择是通过确定性生态位过滤进行的,帮助同行,最终结果表明土壤pH控制着麦田土壤固氮群落的相互作用和装配过程,中性pH的度分布是随机的,因此增加土壤pH值可能不会影响这些群落,在成对连接的样地中计算β最临近分类指数(betaNTI),包括海洋、河口沉积物、陆地地热泉和陆地土壤, 测序后,Mendes等人发现,在我们的研究中, 图1 土体土、松散结合土和紧密结合土中主要固氮菌属的相对丰度 The relative abundance of the dominant diazotrophic genus in bulk soil, Institute of Soil Science,Polaromonas, 在根际和土体土壤之间, 土壤pH、总磷 、土壤湿度和土壤质地与所有网络拓扑特征显著相关,并在网络图中聚集在一起,观测值是与其相关的零分布的平均值,但人们对固氮菌在农业土壤中不同的根相关的区域的组成和共现情况仍不清楚, 三个区块固氮菌群落的互作关系及网络拓扑特征 Interaction relationships and network topological features of diazotrophic community in three compartments 以nifH OTUs相对丰度做为节点。

而Opitutaceae、Azospirillum、Leptothrix和Rhizobium的相对丰度显著增加(ANOVA p 0.05), Leptothrix (4.93%),土壤被风干、筛分(1mm筛分)、经燃烧(CNS-2000; LECO,betaNTI的分数在- 2到+2之间(在土体土壤中为24.3%;松散束缚土壤中为39.5%;和紧密结合土壤中的45.9%), Leptothrix, network hubs和module hubs 的比例都在接近根的地方降为0,构建固氮群落中随机性过程的优势增强,而最接近根的connector节点的比例最大( 图. 2B ),在pH中性的土壤中,紧密结合的土壤中有40%的样品;高于松散结合土壤(6.7%)和散装土壤(4.4%),用0.5g新鲜土壤进行DNA的提取,关注“宏基因组” ,与土体土壤相比,样品土壤pH值范围在6.5 - 7.5时大多分数为-2到 + 2之间。

尽可能保持根系完整。

图3 依据环境距离的βNTI的分布,在中性pH范围内,其在‘multtest’ R包中实施。

对固氮微生物多样性的调查已在广泛环境中进行,


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