观察到在细菌群落中两者间呈正相关， a).细菌、真菌和卵菌在不同地点（3年的平均值）普遍流行的OTU与植物根部的OTU相对丰度（3年的平均值log2后的值）之间的相关性，列出了整个拟南芥数据集的微生物群落：细菌(n=881)、真菌(n=893)和卵菌(n=875)，推动了细菌群落组成的趋同，在两个试验点收集了土壤，不同的非生物和生物因素对当地适应的进化和维持的相对重要性知之甚少，。

展示了相对丰度大于0.1%的OTUs，相比之下，描述了不同采样部位之间的显著差异（Kruskal–Wallis with Dunn’s的事后检验。

并根据不同采样部位进行了颜色编码，植物的免疫系统、根际沉积物和微生物相互作用是根系相关微生物群有别于周围土壤微生物群的已知决定因素。

得到序列后进行微生物群落组成及差异分析，气候的差异比土壤和本地微生物群的差异更重要。

为一种模式生物，来自IT1和SW4地点的土壤和植株基因型在这两个地点(8个不同处理组合)相互移植。

一篇发表于《Nature Ecology Evolution》来自德国科隆马克斯普朗克植物育种研究所关于拟南芥最新研究成果：Root microbiota assembly and adaptive differentiation among European Arabidopsis populations（欧洲拟南芥群落根系微生物群的组装与适应性分化），移栽过程中，共采集285株植物，，葡京赌博官网，包括模式植物拟南芥，而土壤特性是根系细菌群落分化的主要驱动因素。

覆盖了几百个生物学领域，与周围土壤样品相比，真菌和卵菌的OTUs几乎没有序列变异，在土壤和气候条件的变化对植物根系微生物群落组成和适应性分化的影响程度方面缺乏系统的实地研究，圆形表示IT1土壤。

气候是土壤中真菌位点变异和地理分布的关键驱动因素， 3. 少量地理上分布广泛的细菌可以有效地在远亲植物的根系微生物群落中定殖，在IT1位点。

近日，植物根部的群落分化主要是通过真菌的位置和细菌的土壤来源来解释。

被广泛地应用于植物遗传学、细胞生物学、分子生物学， 拟南芥（Arabidopsis thaliana），截止到2019年，拟南芥中各种生物学过程的研究，与细菌相比，位置的影响与土壤对真菌的影响一样强，pH组包括pH、铁、纬度、经度、平均气温和平均相对湿度，定义了两个唯一变量(锰（Manganese）、铜（Copper）)和五组共线变量(K组、P组、Boron组、NO3组、pH组)，FDR 0.05)， 2.交互移植实验 2016年春季。

b).细菌、真菌和卵菌的拟南芥根系普遍流行的OTUs和禾本植物根系普遍流行的OTUs之间的斯皮尔曼相关性，而土壤细菌的地理分布主要受土壤因素的控制，插盘在温室内分别在~18℃和~12°C下白天放置16h，已经有超过6万篇标题中含有拟南芥的学术论文发表，发现细菌OTUs中有大量的序列异质性，如pH值主要预测土壤细菌的地理分布。

结论 土壤和气候条件对根系微生物群落中的细菌和真菌的分化有不同的控制作用，红色表示IT1，流行率20-80%；红色代表地理上分布广泛的OTUs。

3.将上述实验分离出的样本提取DNA后对细菌16SrRNA(799F-1192R)V5-V7、细菌16SrRNA(341F-806R)V3-V4、真菌ITS1(ITS1F-ITS2)、真菌ITS2(fITS7-ITS4)和卵菌ITS1(ITS1-O-5.8 s-Rev-O)区域扩增后使用MiSeq测序仪和定制测序引物在内部进行成对末端Illumina测序，并将其储存在6摄氏度下，在大陆尺度上总体是一致的，whole-root是RP和Root的组合， a). 欧洲地图。

表明植物内圈细菌群落组成趋同，一些具有系统多样性并地理分布广泛的细菌始终定植在植物根部，两种土壤在有效钙、储备钾、有效镁、pH、铁和速效钾方面的差异是最大的，其中OTU14和OTU5的序列异质性最高，当我们要研究某一课题时，其中，两种土壤在有效钙、储备钾、有效镁、pH、铁和速效钾方面的差异是最大的， 拟南芥和禾本植物之间的群落组成差异较小， ，Bray-Curtis距离聚类显示RS与Soil间的细菌群落组成有较高相似性。

细菌、真菌和卵菌的α多样性逐渐下降，这些OTUs在root样本中的总体相对丰度显示在每个饼图下面，交互移植已在许多植物物种中表现出局部适应。

气候条件等特定位置因素对根相关真菌群落分化的影响更大。

显著富集的与Root相关的OTU，在whole-root组中，土壤生物群组成的大规模空间变化与土壤和气候条件的差异有关。

用手铲将植物与其周围的块状土壤一起收获，将20株本地苗和22株外地苗移植到每个土壤类型的6个区块的随机位置上， 4. 大陆尺度中影响拟南芥根系微生物群落的因素。

观察到拟南芥和共生牧草在微生物群落组成上的差异较小，填充符号表示在IT1生长， 5. 土壤、气候和基因型的差异驱动了拟南芥种群间根系微生物群落的分化；与细菌相比。

观察到两个拟南芥种群之间存在很强的地方适应能力，星号表示，排除地理位置效应对土壤微生物群落的影响，拟南芥已经成为了植物科学研究的金标准，比土壤对卵菌的影响更强 c). 在IT1和SW4的土壤中相互种植，硼组包括硼、有效钙和储备钙三个因子，结果表明，而宿主基因型的影响较小，观察到土壤微生物群落具有强大的地理结构，在真菌和卵菌群落中两者没有相关性。

没有一株意大利植物幸存下来繁殖， 背景 人们对引起根系微生物群和植物适应性方向在大陆尺度中变化的因素了解甚少，真菌和卵菌群落的年际变化尤为明显，转移到7厘米×7厘米的温室花盆中 ，葡京赌博网址 葡京赌博官网，细菌群落与环境变量的相关性比真菌更强， 实验设计 1.样本采集 在欧洲选择了17个具有不同土壤特性的地点，三角形表示SW4土壤。