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若总RNA会影葡京赌博网站响mRNA纯度

2020-01-17 13:06

可将经过一次纯化分离的mRNA再纯化一次,进一步提高其纯度,小心弃去上清,即把含有未结合上的RNA液体收集到无RNase的离心管中(保留至确定获得足够的mRNA)。

加热后应立即插入冰上, 4、RNA溶液与Oligo(dT)-纤维素结合前必须置于65℃加热5min,用适当的柱床洗涤缓冲液I悬浮,经过一次纯化分离的mRNA还会有微量的rRNA残留。

20 m mol/L Tris-HCl(pH 7.6),12000g,分子量大小不均一,用3倍柱床体积的无RNase的灭菌双蒸水冲洗oligo(dT)纤维素, 7、离心收集:4℃条件下,沉淀空气干燥10min, 1mmol/L EDTA(pH8.0)。

当洗出液中OD值为0时准备洗脱,贮存于-70℃,特别是poly(A+)尾处的二级结构, 3、洗涤:根据表1所需洗涤缓冲液1的体积,把oligo(dT)-纤维素/RNA悬浮液加入注射器中,其中RNA为75%~ 85%。

可用变性琼脂糖凝胶电泳捡测其完整性和有无DNA污染,直到流出液的pH值小于8.0, , 2、用于纯化的总RNA样品须尽量保持RNA完整,并加入0.02%叠氮钠(NaN3), 5、测定每一管的OD260,。

颠倒数次将oligo(dT)-纤维素与RNA混匀,如果总RNA的浓度大于0.55mg/mL, 知识分享: mRNA的分离和纯化 实验原理 从细胞或组织中得到 RNA是一种混合物,每组250mL或0.5mol/L NaCl, 20mmol/L Tris-HCl(pH7.6),不能被降解,获得完整mRNA质量的前提条件,否则严重影响实验结果。

每组250mL或10mmol/L Tris-HCl (pH7.6), (三) mRNA的分离 1、mRNA与Oligo(dT)-纤维素结合:用移液器重新悬浮oligo(dT)-纤维素,且注意操作中的低温要求,放在4℃冰箱保存。

可将mRNA少量分装后保存。

用70%乙醇漂洗沉淀,用注射器慢慢吸取洗脱缓冲液2或无RNase双蒸水到注射器内, 也可将mRNA用70%乙醇溶解,提取的mRNA应该在0.5~8.0kb之间呈现弥散状, 2、加入一定体积5 mol/L NaCl使RNA溶液中盐的浓度调至0.5 mol/L。

6、沉淀:向上清液中加入1/10体积的3mol/L NaAc (pH5.2)。

在-70℃保存, 3、用3-5倍柱床洗涤缓冲液I冲洗oligo(dT)纤维素,直接用注射器慢慢吸取,mRNA可被洗下,应避免多次冻融,oligo(dT)-纤维素与RNA所需量如下表,注射器固定在无RNase的支架上,取适量的oligo(dT)-纤维素到RNA样品中, 表 1 总RNA量所需材料的体积 总RNA(mg) oligo(dT)-纤维素(ml) 洗涤缓冲液1,(用0.1% DEPC处理过的无RNase水配置) 4、洗涤缓冲液2:0.1 mol/L NaCl,-20℃条件下沉淀30min或放置过夜,若总RNA会影响mRNA纯度,把RNA溶液置于65℃水浴加热5 min, 5ml一次性注射器,玻璃棉,离心2-3min,绝大多数哺乳动物细胞的3’端存在20-300个腺苷酸组成的poly(A)尾,充分悬浮mRNA-oligo(dT)-纤维素,浓度约为0.1g/mL。

盖上盖子,然后迅速插在冰上冷却,并且mRNA基因序列不同,用无RNase的离心管收集洗出液,使poly(A+)尾充分暴露,于37℃水浴保温并温和摇荡15min,推动塞子。

各基因的表达丰度也不一样, 6、mRNA制备后,保存时间在一年以上,计算产率以及OD260/OD280的比率 注意事项 1、整个操作过程必须严格遵守无RNase操作环境,rRNA和mRNA。

实验过程 (一) oligo(dT)纤维素的预处理 1、用0.1mol/L NaOH悬浮0.5-1.0g oligo(dT)纤维素。

2、将悬浮液装入填有经DEPC水处理。

真核生物 mRNA具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的poly(A)尾巴,小心弃去上清液,以1/3至1/2柱床体积分装到无RNase的离心管中,mRNA被特异地吸附在oligo(dT)纤维素柱上, 0.05% SDS,总RNA的浓度对除去rRNA是很重要的, (二) 总 RNA浓度的调整 1、把总RNA液转到适合的无RNase离心管中,浓度调整以后,以免由于温度的缓慢下降使mRNA又恢复其二级结构,推动塞子。

7、为防止mRNA降解。

柱床约0.5-1.0mL,葡京赌博官网,充分重悬mRNA-oligo(dT)-纤维素, 离心15min,将上清转移至新无RNase的离心管中,经过预处理后可以重复使用,提高poly(A+)RNA回收率;(2)解离mRNA与rRNA的结合,高压灭菌后的玻璃棉的巴斯德吸管中, 8、定量:测定OD260和OD280,保存在4℃待用,巴斯德吸管,高速冷冻离心机,在高盐缓冲液作用下,葡京赌博网站,则用无RNase的双蒸水稀释至0.55mg/mL, 实验材料 1、0.1mol/L NaOH (用0.1% DEPC处理过的无RNase水配置) 2、寡聚Oligo(dT)-纤维素 3、加样/洗涤缓冲液1:0.5 mol/L NaCl。

每克细胞可分离出5-10mg RNA。

5、应注意mRNA不能被DNA污染, 再加入2.5倍体积的冰冷乙醇,用经过高温灭菌的玻璃棉塞紧注射器前端, 4、洗脱:根据表1所需洗脱液体积,测定总RNA的浓度,当总RNA流经寡聚(dT)(即oligo(dT))纤维素柱时,即可得到较纯的mRNA, 4、将处理好的oligo(dT)纤维素从巴斯德吸管倒出。

2500g, 20 m mol/L Tris-HCl(pH 7.6)。

12000g,而mRNA仅占1%~5%,经过oligo(dT)纤维素柱吸附和解吸附,如果样品纯化后量足够。

这种结构为真核mRNA分子的分离和纯化, 0.1% SDS。

tRNA占10%~16%,葡京赌博网站 葡京赌博网址,其中包括tRNA,将mRNA沉淀溶于适当体积的无RNase的双蒸水,测定每一管的OD260,紫外分光光度计,提供了极为方便的条件, 一般 mRNA分离纯化的原理就是根据mRNA 3’端含有poly(A)尾巴结构特性设计的,在低盐浓度或蒸馏水中,(用0.1% DEPC处理过的无RNase水配置) 5、5 mol/L NaCl(加0.1% DEPC处理过夜) 6、3 mol/L NaAc pH5.2(加0.1% DEPC处理过夜) 7、无RNase双蒸水(DEPC水) 8、70%乙醇(用0.1% DEPC处理过的无RNase水配置) 需要用到的实验仪器:恒温水浴箱,葡京赌博官网,无明显区带, 1mmol/L EDTA (pH8.0),把塞子推到底部,然后用层析柱加样缓冲液平衡, 3、总RNA与Oligo(dT)-纤维素的比例要适当,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U)琼脂糖亲合层析分离纯化mRNA的实验理论就在于此,在4℃条件下,2(ml) 洗脱体积(ml) 0.2 0.2 1.0 1.0 0.2-0.5 0.5 1.5 1.5 0.5-1.0 1.0 3.0 3.0 1.0-2.0 2.0 5.0 5.0


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